Mientras Sonic y los Chaotix luchan contra peligrosos robots… ¡¿Un momento, qué hacen Shadow y Rouge aquí?! Unidos para descubrir el próximo plan del Dr. Eggman, Sonic y los Chaotix siguen su última pista hasta una base secreta empapada por la lluvia y repleta de robots peligrosos. La situación se torna rápidamente aterradora, y deben preguntarse: ¿Encontrarán las respuestas que buscan? ¿O habrán caído directamente en una trampa del Dr. Eggman? ¡Pero eso no es todo! Todo se complica aún más con la llegada de Shadow y Rouge, dejando a nuestros héroes preguntándose si están allí para ayudarlos… o para empeorar aún más las cosas.