Con Leonardo, Michelangelo y Raphael en busca de nuevos aliados para unirse a los buenos contra el último plan mortal del Rey Rata, Donatello y Jennika deben liderar la lucha en Ciudad Mutante contra el temible trío formado por el alcalde Baxter Stockman, el general Krang y Madame Null. Pero ¿lograrán un peligroso cuarteto de tortugas ninja mutantes enmascaradas y un viviseccionista demente sediento de venganza, sin mencionar a los invasores de la EPF y los furiosos soldados Utrom, sabotear sus esfuerzos antes incluso de que puedan empezar a defenderse? Incluye los números 133-139, que sirven como enlace directo al emocionante evento TMNT: El Juego del Armagedón.